Kajian struktur metalotionin (protein pengikat logam) melalui simulasi dinamik molekul

Tan Kwee Hong (P48540)

Please use this identifier to cite or link to this item: https://ptsldigital.ukm.my/jspui/handle/123456789/463236

Full metadata record

DC Field	Value	Language
dc.contributor.advisor	Zeti Azura Mohamed Hussein, Dr.
dc.contributor.author	Tan Kwee Hong (P48540)
dc.date.accessioned	2023-09-25T09:19:31Z	-
dc.date.available	2023-09-25T09:19:31Z	-
dc.date.issued	2012-10-08
dc.identifier.other	ukmvital:73410
dc.identifier.uri	https://ptsldigital.ukm.my/jspui/handle/123456789/463236	-
dc.description	Metalotionin merupakan kumpulan protein kaya-sistina yang berupaya berikat dengan pelbagai ion logam dengan membentuk kluster logam tiolat. Kajian simulasi struktur protein yang berikat dengan ion logam adalah sukar dilakukan kerana pengaruh pemindahan caj dan elektron serta kepolaran asid amino dalam menghasilkan koordinasi struktur yang betul sewaktu proses pemodelan. Dalam kajian ini, proses simulasi dinamik molekul (MD) telah dilakukan ke atas kompleks Cd-MT dengan menggunakan parameter medan daya yang telah dioptimumkan. Parameter optimum untuk kluster kadmium-tiolat dalam kompleks Cd-MT telah diaplikasikan dalam medan daya CHAMM22 sebelum proses simulasi MD dilakukan. Struktur MT dihablurkan di dalam kotak kubik, dineutralkan dan diseimbangkan sebelum ianya disimulasikan selama 5 nanosaat (ns). Analisis trajektori menunjukkan bahawa tulang belakang protein mempunyai daya keanjalan yang tinggi apabila keseluruhan struktur protein distabilkan oleh kluster kadmium-tiolat. Atom-atom di dalam kluster kadmium-tiolat menunjukkan perbezaan yang sangat kecil sewaktu proses simulasi 5 ns dijalankan ke atas kompleks ini dan juga tiada kesan kewujudan struktur sekunder. Proses simulasi MD yang telah dilakukan ke atas kompleks ini telah menunjukkan bahawa perlakuan dan kestabilan MT adalah sangat bergantung kepada kewujudan kluster logam-tiolat yang terbentuk di dalam struktur protein ini. Kajian ini juga mendapati bahawa perlekatan MT dengan ion- ion logam yang berbeza turut menyumbang kepada pelbagai ciri struktur MT antaranya seperti koordinasi geometri di dalam domain MT.,Master/Sarjana
dc.language.iso	may
dc.publisher	UKM, Bangi
dc.relation	Faculty of Science and Technology / Fakulti Sains dan Teknologi
dc.rights	UKM
dc.subject	Metalotionin (protein pengikat logam)
dc.subject	Simulasi dinamik molekul
dc.subject	Metalloproteins
dc.title	Kajian struktur metalotionin (protein pengikat logam) melalui simulasi dinamik molekul
dc.type	theses
dc.format.pages	113
dc.identifier.callno	QP552.M47.T344 2012
dc.identifier.barcode	000358
Appears in Collections:	Faculty of Science and Technology / Fakulti Sains dan Teknologi

Files in This Item:

File	Description	Size	Format
ukmvital_73410+Source01+Source010.PDF Restricted Access		6.47 MB	Adobe PDF	View/Open

Show simple item record Recommend this item