Please use this identifier to cite or link to this item:
https://ptsldigital.ukm.my/jspui/handle/123456789/463232| Title: | Kesan plasma dan glukosa ke atas transkriptom Burkholderia pseudomallei |
| Authors: | Shaniza binti Abdul Aziz (P45160) |
| Supervisor: | Sheila Nathan, Prof. Dr. |
| Keywords: | Plasma Glukosa Transkriptom Burkholderia pseudomallei Microbiology |
| Issue Date: | 22-Nov-2012 |
| Description: | Burkholderia pseudomallei adalah agen penyebab penyakit melioidosis. Ia merupakan penyebab utama septisemia perolehan komuniti di Asia Tenggara dan setinggi 60% daripada individu terjangkit adalah pesakit diabetik. Untuk memahami penyesuaian tapak jalan metabolisme dan faktor kevirulenan B. pseudomallei semasa bakteremia, perbandingan transkriptom dua pencilan klinikal B. pseudomallei, D286 dan IMR, yang dikultur dalam plasma darah dengan bakteria yang tumbuh dalam kaldu LB telah dijalankan. Kedua-dua pencilan ini dipilih kerana menunjukkan tahap kevirulenan berbeza dalam model hos, Caenorhabditis elegans. Profil transkriptom B. pseudomallei D286 menunjukkan sebanyak 40% daripada genom terkawalatur apabila terdedah kepada plasma. Walaupun majoriti gen ini di dalam pencilan D286 mengalami pengaruhan, lebih banyak gen yang tertindas dalam pencilan IMR. Kebanyakan gen-gen yang menunjukkan pembezaan pengekspresan terlibat dalam fungsi-fungsi penting seperti metabolisme, sampul sel dan motiliti, replikasi serta fungsi pengawalaturan. Perubahan umum dalam gen-gen metabolisme menggambarkan penyesuaian terhadap kandungan nutrien yang berbeza dalam plasma berbanding media LB. Corak penyesuaian yang sama pernah dilaporkan dalam kajian ke atas Yersinia pestis dan Staphylococcus aureus. Faktor-faktor kevirulenan seperti sistem perembesan jenis III (TTSS), sistem perembesan jenis VI (T6SS) dan flagelum juga teraruh. Aruhan gen-gen yang melibatkan pembahagian sel dan replikasi menunjukkan kebolehan B. pseudomallei untuk membiak dengan baik dalam plasma. Untuk mengkaji fenomena hiper-kerentanan pesakit diabetes terhadap melioidosis, glukosa telah ditambah ke dalam plasma dan perbezaan transkriptom bakteria dengan kehadiran glukosa telah dianalisis. Dengan kehadiran glukosa, pola pengekspresan yang berbeza di antara kedua-dua pencilan diperhatikan. Pencilan D286 tidak menunjukkan perubahan pengekspresan, manakala lebih 1000 gen pada peringkat transkriptom pencilan IMR mengalami pembezaan pengekspresan. Kumpulan-kumpulan gen yang telah dikawal atur termasuk pengangkutan dan pengikatan, sampul sel dan juga metabolisme. Apabila kajian ini dilanjutkan untuk melihat kesan modulasi transkriptom ke atas kemandirian C. elegans, pencilan IMR yang dikultur dalam kehadiran glukosa didapati membunuh C. elegans dengan lebih cepat. Walaupun kebanyakan gen yang dikawalatur adalah tertindas, pengawalaturan gen-gen elemen bakteriofaj mencadangkan peranan elemen baru yang membolehkan pencilan IMR berkelakuan menunjukkan sifat lebih virulen apabila terdedah kepada glukosa. Kajian transkriptom B. pseudomallei dalam plasma telah meningkatkan pemahaman proses penyesuaian bakteria semasa peringkat jangkitan bakteremia serta kesan glukosa terhadap jangkitan B. pseudomallei.,Master/Sarjana |
| Pages: | 99 |
| Call Number: | QR61.S525 2012 |
| Publisher: | UKM, Bangi |
| Appears in Collections: | Faculty of Science and Technology / Fakulti Sains dan Teknologi |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| ukmvital_73364+Source01+Source010.PDF Restricted Access | 1.82 MB | Adobe PDF |  View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.