Please use this identifier to cite or link to this item:
https://ptsldigital.ukm.my/jspui/handle/123456789/499491Full metadata record
| DC Field | Value | Language |
|---|---|---|
| dc.contributor.advisor | Rahmah Mohamed, Prof. Dato' Dr. | - |
| dc.contributor.author | Noraslinda Muhammad Bunnori (P24900) | - |
| dc.date.accessioned | 2023-10-13T09:32:19Z | - |
| dc.date.available | 2023-10-13T09:32:19Z | - |
| dc.date.issued | 2013-01-18 | - |
| dc.identifier.other | ukmvital:75014 | - |
| dc.identifier.uri | https://ptsldigital.ukm.my/jspui/handle/123456789/499491 | - |
| dc.description | Burkholderia pseudomallei sebagai/adalah agen penyebab penyakit melioidosis telah dilaporkan menghasilkan pelbagai produk estrasel termasuk peptidase. Namun, peranan sebenar peptidase dalam kevirulenan patogen tersebut masih lagi dalam kajian. Beberapa kajian yang telah dijalankan mendapati protease terlibat dalam kepatogenan semasa infeksi B. pseudomallei. Dalam kajian B. pseudomallei D286 ini, dua famili peptidase telah dipilih iaitu peptidase serina dan peptidase metalo. Pendekatan kaedah bioinformatik dengan menggunakan genom B. pseudomallei K96243 menghasilkan 80 rangka bacaan terbuka (ORF) yang mempunyai potensi mengekod peptidase tersebut. Penganotasian serta pengklasifikasian telah mencirikan 48 peptidase putatif daripada famili peptidase serina manakala 32 peptidase putatif daripada famili peptidase metalo. Sebanyak 98% daripada keseluruhan peptidase putatif terdiri daripada endopeptidase dan eksopeptidase sementara 2% daripada enzim hidrolase. Sebanyak 12 ORF telah diamplifikasi daripada genom B. pseudomallei D286. Hasil fragmen telah diklonkan ke dalam pET200/D-TOPO dan penjujukan berautomasi dilakukan untuk memastikan jujukan dalam orientasi yang betul. Plasmid rekombinan kemudiannya ditransformasikan ke dalam Escherichia coli strain BL21(DE3). Analisis kaseinolitik menunjukkan klon rekombinan berjaya dibezakan secara bererti dengan menghidrolisis agar susu skim yang mengandungi perencat spesifik. Empat rekombinan peptidase telah dipilih yang mempunyai fungsi sebagai protease bersandar ATP dan protein kejut haba. BPSL0808 (BPsp005), BPSL1403 (BPsp010), BPSL1405 (BPsp012) dan BPSL2430 (BPmp019) masing-masing mempunyai homologi yang tinggi dengan peptidase DegP/HtrA, protease ClpP, protease La dan endoprotease FtsH. Semua rekombinan peptidase ini diekspres dalam E. coli BL21(DE3) dengan rangsangan 1 mM IPTG pada suhu 30°C selama 3-6 jam. Pencirian aktiviti gelatinolisis yang dilakukan ke atas peptidase tersebut telah memberikan tindak balas positif. Secara keseluruhannya, hasil kajian merumuskan kehadiran jujukan peptidase dalam genom B. pseudomallei telah berjaya dirungkaikan melalui kaedah pengenalpastian tapak aktif serta domain berfungsi secara bioinformatik. Di samping itu, pengesahan secara in vivo membuktikan kehadiran empat peptidase bersandar ATP serta mempunyai ciri protein kejut haba dalam B. pseudomallei D286 berupaya menghidrolisis secara kaseinolitik dan gelatinolisis.,PhD | - |
| dc.language.iso | may | - |
| dc.publisher | UKM, Bangi | - |
| dc.relation | Faculty of Science and Technology / Fakulti Sains dan Teknologi | - |
| dc.rights | UKM | - |
| dc.subject | Pengenalpastian Peptidase Burkholderia Pseudomallei | - |
| dc.subject | Pencirian Peptidase Burkholderia Pseudomallei | - |
| dc.subject | Peptidase Burkholderia Pseudomallei D286 | - |
| dc.subject | Microbiology | - |
| dc.title | Pengenalpastian Dan Pencirian Peptidase Burkholderia Pseudomallei D286 | - |
| dc.type | Theses | - |
| dc.format.pages | 197 | - |
| dc.identifier.callno | QR82.P78 .N646 2013 | - |
| dc.identifier.barcode | 000227 | - |
| Appears in Collections: | Faculty of Science and Technology / Fakulti Sains dan Teknologi | |
Files in This Item:
| File | Description | Size | Format | |
|---|---|---|---|---|
| ukmvital_75014+Source01+Source010.PDF Restricted Access | 3.24 MB | Adobe PDF |  View/Open |
Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.