Pemencilan dan pencirian gen daripada tisu bunga calamus palustris griff dengan menggunakan penghibridan subtraktif penindasan

Ng Chun Yang (P54301)

Please use this identifier to cite or link to this item: https://ptsldigital.ukm.my/jspui/handle/123456789/463641

Full metadata record

DC Field	Value	Language
dc.contributor.advisor	Choong Chee Yen, Prof. Madya Dr.
dc.contributor.author	Ng Chun Yang (P54301)
dc.date.accessioned	2023-09-25T09:32:35Z	-
dc.date.available	2023-09-25T09:32:35Z	-
dc.date.issued	2013-05-08
dc.identifier.other	ukmvital:85149
dc.identifier.uri	https://ptsldigital.ukm.my/jspui/handle/123456789/463641	-
dc.description	Calamus palustris Griff. merupakan spesies rotan diesius yang penting dan bernilai di Malaysia. Pengenalpastian seks pokok hanya dapat dilakukan selepas pokok mula berbunga pada umur 3-4 tahun. Keadaan ini telah menyusahkan pembangunan kebun benih untuk penghasilan biji benih C. palustris. Untuk mengenalpasti gen spesifik seks pada C. palustris, perpustakaan subtraktif cDNA bunga betina dan bunga jantan telah dijana dengan menggunakan kaedah penghibridan subtraktif penindasan (SSH). Sebanyak 1056 klon telah dikultur bagi perpustakaan subtraktif cDNA bunga betina (SSH Betina), dan analisis memberikan 965 klon yang berkualiti tinggi. Namun, penyaringan dengan Northern berbalik ke atas klon tersebut tidak dapat mengesan sebarang klon yang terekspres secara berbeza dalam perpustakaan SSH Betina. Sebaliknya, perpustakaan subtraktif cDNA jantan (SSH Jantan) mengandungi 1536 klon, dan analisis menunjukkan 1419 klon adalah yang berkualiti tinggi. Penyaringan Northern berbalik berjaya mengenalpasti 313 gen yang terekspres secara berbeza dalam perpustakaan SSH Jantan. Penjujukan telah dilakukan ke atas 313 gen tersebut, dan ini menghasilkan 205 unigen yang terdiri daripada 32 kontig dan 173 jujukan tunggal. Pengenalpastian homologi Blastx ke atas 205 unigen dengan pangkalan data protein NCBI menunjukkan 171 unigen mempunyai pemadanan yang signifikan (Evalue ≤10-5). Kesemua unigen tersebut dapat dikelaskan kepada 13 kategori kefungsian protein putatif. Sebanyak lapan gen dengan kefungsian dalam pembentukan bunga dan sembilan gen lain yang memainkan peranan penting dalam pembentukan bunga jantan telah dikenalpasti. Gen-gen tersebut berpotensi digunakan untuk pembangunan penanda molekul untuk pengenalpastian seks dalam C. palustris. Sebanyak lima gen iaitu Beta galactosidase 13, Pollen Ole e 1 allergen and extensin family , beta-glucosidase 1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase dan Glutamate decarboxylase telah dipilih untuk pengesahan pengekspresan gen dalam tisu bunga jantan dan tisu bunga betina dengan menggunakan pendekatan transkriptase berbalik kuantitatif PCR. Tahap pengekspresan relatif bagi kelima-lima gen menunjukkan perbezaan pengekspresan lebih tinggi pada tisu bunga jantan berbanding tisu bunga betina. Perbezaan pengekspresan Beta galactosidase 13 adalah sebanyak 1530 kali ganda, Pollen Ole e 1 allergen and extensin family sebanyak 256 kali ganda, betaglucosidase 1 sebanyak 56 kali ganda, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase sebanyak 4 kali ganda dan Glutamate decarboxylase sebanyak 1.6 kali ganda lebih pada bunga jantan. Pemencilan gen daripada tisu bunga jantan dan tisu bunga betina mencadangkan gen penentuan jantina mungkin hadir pada pokok jantan C. palustris. Data yang diperoleh dalam kajian ini boleh digunakan sebagai sumber penanda molekul dalam kajian terperinci bagi penentuan seks C. palustris pada masa akan datang.,Master / Sarjana
dc.language.iso	may
dc.publisher	UKM, Bangi
dc.relation	Faculty of Science and Technology / Fakulti Sains dan Teknologi
dc.rights	UKM
dc.subject	Calamus palustris Griff
dc.subject	Calamus
dc.title	Pemencilan dan pencirian gen daripada tisu bunga calamus palustris griff dengan menggunakan penghibridan subtraktif penindasan
dc.type	theses
dc.format.pages	106
dc.identifier.callno	QK982.N43 2013
dc.identifier.barcode	002198
Appears in Collections:	Faculty of Science and Technology / Fakulti Sains dan Teknologi

Files in This Item:

File	Description	Size	Format
ukmvital_85149+SOURCE1+SOURCE1.0.PDF Restricted Access		2.38 MB	Adobe PDF	View/Open

Show simple item record Recommend this item