1. UKM Learning and Research Repository
2. Master Thesis / Tesis Master
3. Faculty of Science and Technology / Fakulti Sains dan Teknologi

Title:	Pengekstrakan dan pencirian elisitor protein dan glikoprotein daripada Magnaporthe grisea 7.6
Authors:	Hari Kumar Krishnan (P54227)
Supervisor:	Kalaivani Nadarajah, Prof. Madya. Dr.
Keywords:	Rice blast disease
Issue Date:	8-Aug-2015
Description:	Penyakit karah padi yang disebabkan oleh kulat Magnaporthe grisea merupakan salah satu penyakit padi yang serius di dunia. Pendekatan proteomik diambil untuk menganalisa elisitor protein yang diperoleh daripada Magnaporthe grisea. Elisitor adalah sebatian isyarat yang bertindak pada kepekatan rendah dan terlibat dalam pencetusan sistem pertahanan tumbuhan. Objektif utama kajian ini adalah untuk memencil dan mencirikan protein elisitor dan glikoprotein daripada kulat tersebut dan memerhatikan tindak balas tumbuhan terhadap rawatan dengan menggunakan elisitor tersebut. Analisa perbandingan 2-D ekstrak protein jumlah/mentah dapat mengenal pasti 77 tompok protein menerusi MALDI-TOF. Protein-protein ini kemudiannya dikelaskan ke dalam 8 kumpulan. Kluster hipotetikal mengandungi paling banyak protein dengan 31 protein. Ini diikuti oleh transferase dengan 19, tenaga dan metabolisma karbon dengan 12, oksidoreduktase dengan 7, ―molecular chaperone‖ dengan 3, hidrolase dengan 2, organisasi struktur dengan 2 dan akhirnya kinase dengan 1 protein. Sesetengah kluster ini seperti tenaga dan metabolisma karbon serta hidrolase penting dalam patogenesis dan kepatogenan mikrob. Elisitor protein ditulenkan dengan menggunakan teknik kromatografi pengecualian saiz manakala glikoprotein ditulenkan dengan kaedah kromatografi affiniti. Saiz elisitor telah ditentukan dengan menggunakan SDS-PAGE. Saiz elisitor protein adalah dianggarkan di antara 60-80 kDa, manakala saiz glikoprotein di anggarkan di antara 25-30 kDa. Kandungan protein juga telah ditentukan dengan menggunakan teknologi MALDI-TOF. Protein dan glikoprotein didapati mempunyai persamaan dengan Concanavalin A selepas pencarian di dalam pangkalan data. Kemudian, kandungan protein juga telah dikenal pasti dengan menggunakan LC-MS berdasarkan dua pangkalan data, SWISS-PROT bagi protein am dan UNIPROT bagi protein kulat M. grisea. Carian SWISS-PROT mendapati kedua-dua protein elisitor mempunyai persamaan dengan Concanavalin A, tripsin dan juga lektin. Manakala carian UNIPROT tidak memberi sebarang padanan bagi elisitor protein. Bagaimanapun, elisitor glikoprotein didapati mempunyai persamaan dengan protein M. grisea. Jujukan asid amino elisitor protein juga telah diperolehi dengan menggunakan penjujukan terminal N bagi 14 asid amino. Jujukan ini kemudiannya dianalisa dengan Blastp dan didapati jujukan ini tidak mempunyai persamaan signifikan dengan mana-mana jujukan. Pencarian kefungsian protein tidak memberikan sebarang hasil menerusi perisian Pfam. Ini menunjukkan protein ini kebarangkalian adalah novel dan belum dicirikan, Penentuan kepekatan karbohidrat di dalam elisitor protein juga dilakukan dengan kaedah Somogyi-Nelson. Nilai min kepekatan karbohidrat bagi kepekatan elisitor 1000 µg adalah 758.99 µg/µL. Asai bahan meruap turut dijalankan untuk melihat kesan bahan elisitor terhadap tumbuhan. Varieti padi MR219 digunakan dalam analisis ini. Bahan-bahan seperti naftalena, stirena dan limonene dibebaskan oleh dedaun padi. Sesetengah bahan ini telah dikenal pasti mempunyai sifat antimikrob.,Sarjana Sains Bioteknologi Tumbuhan
Pages:	190
Call Number:	SB608.R5H347 2015
Publisher:	UKM, Bangi
Appears in Collections:	Faculty of Science and Technology / Fakulti Sains dan Teknologi

Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.