Pembinaan perpustakaan fosmid leucosporidium antarcticum dan pemencilan gen mengekod protein antibeku

Siti Hamidah Abdul Rahman (P30160)

Please use this identifier to cite or link to this item: https://ptsldigital.ukm.my/jspui/handle/123456789/463473

Full metadata record

DC Field	Value	Language
dc.contributor.advisor	Farah Diba Abu Bakar, Dr.
dc.contributor.author	Siti Hamidah Abdul Rahman (P30160)
dc.date.accessioned	2023-09-25T09:26:29Z	-
dc.date.available	2023-09-25T09:26:29Z	-
dc.date.issued	2011-12-15
dc.identifier.other	ukmvital:81885
dc.identifier.uri	https://ptsldigital.ukm.my/jspui/handle/123456789/463473	-
dc.description	Kajian awal terhadap genom Leucosporidium antarcticum, yis psikrofil pencilan Antartika telah mengenalpasti jujukan separa gen protein antibeku, iaitu AFP1 dan AFP2 serta gen yang mengekod protein teras lipopolisakarida dan ornitin karbomiltransferase. Objektif kajian ini adalah untuk membina perpustakaan fosmid L. antarcticum untuk menyaring dan memencilkan gen tersebut serta mencirikan produk gen-gen tersebut. Perpustakaan fosmid yang dihasilkan meliputi sepuluh kali saiz genom L. antarcticum yang dianggarkan bersaiz 10 Mb. Purata saiz selitan yang dibawa oleh setiap klon adalah 28.5 kb. Penyaringan perpustakaan L. antarcticum untuk mengesan gen antibeku AFP1 dan AFP2 telah diperoleh tetapi tidak untuk gen protein teras lipopolisakarida dan gen ornitin karbomiltransferase walaupun lebih enam kali saiz genom telah disaring. Fosmid yang membawa gen AFP1 dan AFP2 masing-masing telah dinamakan sebagai LaFOS002G01 dan LaFOS008D06. DNA selitan setiap fosmid telah diserpih sebelum diklonkan di dalam plasmid pCR @ 4Blunt-TOPO untuk membina perpustakaan plasmid. Sebanyak 576 klon plasmid daripada perpustakaan LaFOS002G01 dan 836 klon LaFOS008D06 telah dijujuk sebelum dihimpunkan menggunakan perisian Staden Package. Jujukan LaFOS002G01 telah menghasilkan lapan kontig manakala LaFOS008D06 telah menghasilkan satu kontig. Analisis BLAST terhadap kontig gagal menjumpai sebarang padanan dengan jujukan AFP1 pada kelapan-lapan kontig tetapi menunjukkan padanan dengan AFP2 pada kedudukan 31503-31676 daripada LaFOS008D06. Gen-gen lain turut dikenalpasti daripada fosmid, termasuklah gen yang mengekodkan protein pengikat aktin, protein pengikat peptida dan protein kaya histidina. AFP2 dikenalpsti mempunyai empat intron dan 197 asid amino. Terdapat juga tapak miristolasi yang menunjukkan kemungkinan protein AFP2 merupakan protein yang dirembes keluar dari sel. Analisis motif menunjukkan AFP2 mempunyai tapak putatif untuk N-miristolasi, tapak fosforilasi kasein kinase II dan tapak protein kinase C. Protein ini juga diramal mempunyai berat molekul 12881.2 Dalton, adalah protein alkali dan stabil terhadap suhu yang lebih tinggi daripada persekitarannya.,Sarjana
dc.language.iso	may
dc.publisher	UKM, Bangi
dc.relation	Faculty of Science and Technology / Fakulti Sains dan Teknologi
dc.rights	UKM
dc.subject	Antifreeze proteins.
dc.subject	Fosmid leucosporidium
dc.title	Pembinaan perpustakaan fosmid leucosporidium antarcticum dan pemencilan gen mengekod protein antibeku
dc.type	theses
dc.format.pages	108
dc.identifier.callno	QP552.A56 S587 2011
dc.identifier.barcode	001537
Appears in Collections:	Faculty of Science and Technology / Fakulti Sains dan Teknologi

Files in This Item:

File	Description	Size	Format
ukmvital_81885+SOURCE1+SOURCE1.0.PDF Restricted Access		3.95 MB	Adobe PDF	View/Open

Show simple item record Recommend this item